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ATP fosforribosiltransferasa

En enzimología , una ATP fosforribosiltransferasa ( EC 2.4.2.17) es una enzima que cataliza la reacción química

1-(5-fosfo-D-ribosil)-ATP + difosfato ATP + 5-fosfo-alfa-D-ribosa 1-difosfato

Así, los dos sustratos de esta enzima son el 1-(5-fosfo-D-ribosil)-ATP y el difosfato , mientras que sus dos productos son el ATP y la 5-fosfo-alfa-D-ribosa 1-difosfato.

Esta enzima pertenece a la familia de las glicosiltransferasas , específicamente a las pentosiltransferasas. El nombre sistemático de esta clase de enzimas es 1-(5-fosfo-D-ribosil)-ATP:difosfato fosfo-alfa-D-ribosil-transferasa . Otros nombres de uso común incluyen fosforribosil-ATP pirofosforilasa , adenosina trifosfato fosforibosiltransferasa , fosforribosiladenosina trifosfato:pirofosfato , fosforribosiltransferasa , fosforribosil ATP sintetasa , fosforribosil ATP:pirofosfato fosforibosiltransferasa , fosforribosil-ATP:pirofosfato-fosforribosil fosfotransferasa , fosforribosiladenosina trifosfato pirofosforilasa y fosforribosiladenosina trifosfato sintetasa .

Esta enzima cataliza el primer paso en la biosíntesis de histidina en bacterias , hongos y plantas . Es miembro de la superfamilia de enzimas fosforribosiltransferasas , que catalizan la condensación de 5-fosfo-alfa-D-ribosa 1-difosfato con bases nitrogenadas en presencia de iones metálicos divalentes . [1]

La biosíntesis de histidina es un proceso energéticamente costoso y la actividad de la ATP fosforribosiltransferasa está sujeta a control en varios niveles. La regulación transcripcional se basa principalmente en las condiciones de los nutrientes y determina la cantidad de enzima presente en la célula, mientras que la inhibición por retroalimentación modula rápidamente la actividad en respuesta a las condiciones celulares . Se ha demostrado que la enzima es inhibida por 1-(5-fosfo-D-ribosil) -ATP , histidina, ppGpp (una señal asociada con condiciones ambientales adversas) y ADP y AMP (que reflejan el estado energético general de la célula). Como esta vía de biosíntesis de histidina está presente solo en procariotas , plantas y hongos, esta enzima es un objetivo prometedor para el desarrollo de nuevos compuestos antimicrobianos y herbicidas .

La ATP fosforribosiltransferasa se encuentra en dos formas distintas: una forma larga que contiene dos dominios catalíticos y un dominio regulador C-terminal, y una forma corta en la que falta el dominio regulador. La forma larga es catalíticamente competente, pero en los organismos con la forma corta, se requiere un parálogo de histidil-ARNt sintetasa , HisZ, para la actividad enzimática . [2]

Se han determinado las estructuras de las enzimas de forma larga de Escherichia coli y Mycobacterium tuberculosis . [3] [4] La interconversión entre las diversas formas es en gran medida reversible y está influenciada por la unión de los sustratos naturales y los inhibidores de la enzima. Los dos dominios catalíticos están unidos por una lámina beta de dos cadenas y juntos forman un " pliegue de proteína de unión periplásmica ". Una grieta entre estos dominios contiene el sitio activo . El dominio C-terminal no está directamente involucrado en la catálisis, pero parece estar involucrado en la formación de hexámeros, inducidos por la unión de inhibidores como la histidina a la enzima, regulando así la actividad.

Estudios estructurales

A finales de 2007, se han resuelto 10 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1H3D, 1NH7, 1NH8, 1O63, 1O64, 1Q1K, 1USY, 1VE4, 1Z7M y 1Z7N.

Referencias

  1. ^ Sinha SC, Smith JL (diciembre de 2001). "La familia de proteínas PRT". Curr. Opin. Struct. Biol . 11 (6): 733–9. doi :10.1016/S0959-440X(01)00274-3. PMID  11751055.
  2. ^ Sissler M, Delorme C, Bond J, Ehrlich SD, Renault P, Francklyn C (agosto de 1999). "Un parálogo de la aminoacil-ARNt sintetasa con un papel catalítico en la biosíntesis de histidina". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 96 (16): 8985–90. Bibcode :1999PNAS...96.8985S. doi : 10.1073/pnas.96.16.8985 . PMC 17719 . PMID  10430882. 
  3. ^ Lohkamp B, McDermott G, Campbell SA, Coggins JR, Lapthorn AJ (febrero de 2004). "La estructura de la ATP-fosforribosiltransferasa de Escherichia coli: identificación de los sitios de unión del sustrato y el modo de inhibición de AMP". J. Mol. Biol . 336 (1): 131–44. doi :10.1016/j.jmb.2003.12.020. PMID  14741209.
  4. ^ Cho Y, Sharma V, Sacchettini JC (marzo de 2003). "Estructura cristalina de la ATP fosforribosiltransferasa de Mycobacterium tuberculosis". J. Biol. Chem . 278 (10): 8333–9. doi : 10.1074/jbc.M212124200 . PMID  12511575.

Lectura adicional

Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR013820
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR013115