APAF1

Proteína de mamíferos hallada en el Homo sapiens

El factor activador de la proteasa apoptótica 1 , también conocido como APAF1 , es un homólogo humano del gen CED-4 de C. elegans . ^{[5] [6] [7]}

Función

La proteína fue identificada en el laboratorio de Xiaodong Wang como un activador de la caspasa-3 en presencia de citocromo C y dATP. ^[8] Este gen codifica una proteína citoplasmática que forma uno de los ejes centrales en la red reguladora de la apoptosis . Esta proteína contiene (desde el extremo N) un dominio de reclutamiento de caspasa ( CARD ), un dominio de ATPasa (NB-ARC), algunos dominios helicoidales cortos y luego varias copias del dominio de repetición WD40 . Al unirse al citocromo c y al dATP , esta proteína forma un apoptosoma oligomérico . El apoptosoma se une y escinde la proteína Procaspasa-9, liberando su forma madura y activada. El mecanismo preciso para esta reacción aún se debate, aunque el trabajo publicado por Guy Salvesen sugiere que el apoptosoma puede inducir la dimerización de la caspasa-9 y la posterior autocatálisis . ^[9] La caspasa-9 activada estimula la posterior cascada de caspasas que compromete a la célula a la apoptosis.

El empalme alternativo da como resultado varias variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. ^[5]

Estructura

APAF1 contiene un dominio CARD con un motivo de clave griega compuesto por seis hélices, un dominio de unión de nucleótidos de pliegue de Rossman, un motivo helicoidal corto y un dominio de hélice alada. ^[10]

Interacciones

Se ha demostrado que APAF1 interactúa con:

• APIP , ^[11]
• Similar a BCL2 1 ^{[12] [13]}
• Caspasa-9 , ^{[14] [11] [15] [12] [13]}
• HSPA4 , ^[16] y
• NLRP1 . ^[14]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000120868 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000019979 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. "Entrez Gene: factor activador de la peptidasa apoptótica APAF1 1".
6. Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X (agosto de 1997). "Apaf-1, una proteína humana homóloga a CED-4 de C. elegans, participa en la activación de la caspasa-3 dependiente del citocromo c". Cell . 90 (3): 405–13. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80501-2 . PMID  9267021. S2CID  18105320.
7. Kim H, Jung YK, Kwon YK, Park SH (1999). "Asignación del gen del factor activador de la proteasa apoptótica 1 (APAF1) a la banda cromosómica humana 12q23 mediante hibridación in situ con fluorescencia". Citogenética y genética celular . 87 (3–4): 252–3. doi :10.1159/000015436. PMID  10702682. S2CID  10377371.
8. Li P, Nijhawan D, Budihardjo I, Srinivasula SM, Ahmad M, Alnemri ES, Wang X (noviembre de 1997). "La formación dependiente del citocromo c y dATP del complejo Apaf-1/caspasa-9 inicia una cascada de proteasas apoptóticas". Cell . 91 (4): 479–89. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80434-1 . PMID  9390557. S2CID  14321446.
9. Pop C, Timmer J, Sperandio S, Salvesen GS (abril de 2006). "El apoptosoma activa la caspasa-9 por dimerización". Molecular Cell . 22 (2): 269–75. doi : 10.1016/j.molcel.2006.03.009 . PMID  16630894.
10. Riedl SJ, Li W, Chao Y, Schwarzenbacher R, Shi Y (abril de 2005). "Estructura del factor 1 activador de la proteasa apoptótica unido a ADP". Nature . 434 (7035): 926–33. Bibcode :2005Natur.434..926R. doi :10.1038/nature03465. PMID  15829969. S2CID  4355459.
11. Cho DH, Hong YM, Lee HJ, Woo HN, Pyo JO, Mak TW, Jung YK (septiembre de 2004). "Inhibición inducida de la lesión isquémica/hipóxica por APIP, una nueva proteína que interactúa con Apaf-1". The Journal of Biological Chemistry . 279 (38): 39942–50. doi : 10.1074/jbc.M405747200 . PMID  15262985.
12. Hu Y, Benedict MA, Wu D, Inohara N, Núñez G (abril de 1998). "Bcl-XL interactúa con Apaf-1 e inhibe la activación de la caspasa-9 dependiente de Apaf-1". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (8): 4386–91. Bibcode :1998PNAS...95.4386H. doi : 10.1073/pnas.95.8.4386 . PMC 22498 . PMID  9539746. 
13. Pan G, O'Rourke K, Dixit VM (marzo de 1998). "Caspasa-9, Bcl-XL y Apaf-1 forman un complejo ternario". The Journal of Biological Chemistry . 273 (10): 5841–5. doi : 10.1074/jbc.273.10.5841 . PMID  9488720.
14. Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (marzo de 2001). "Un nuevo potenciador del apoptosoma Apaf1 implicado en la activación de la caspasa dependiente del citocromo c y la apoptosis". The Journal of Biological Chemistry . 276 (12): 9239–45. doi : 10.1074/jbc.M006309200 . PMID  11113115.
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16. Saleh A, Srinivasula SM, Balkir L, Robbins PD, Alnemri ES (agosto de 2000). "Regulación negativa del apoptosoma Apaf-1 por Hsp70". Nature Cell Biology . 2 (8): 476–83. doi :10.1038/35019510. PMID  10934467. S2CID  20374981.

Enlaces externos

• Página de detalles del gen APAF1 y ubicación del genoma humano en el navegador de genoma de la UCSC .
• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O14727 (Factor activador de la proteasa apoptótica 1) en PDBe-KB .

Lectura adicional

• Smith TF, Gaitatzes C, Saxena K, Neer EJ (mayo de 1999). "La repetición WD: una arquitectura común para diversas funciones". Tendencias en ciencias bioquímicas . 24 (5): 181–5. doi : 10.1016/S0968-0004(99)01384-5 . PMID  10322433.
• van Oirschot JT (agosto de 1999). "Vacunas Diva que reducen la transmisión del virus". Revista de biotecnología . 73 (2–3): 195–205. doi :10.1016/S0168-1656(99)00121-2. PMID  10486928.
• Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (junio de 2002). "Construcción de clones de ADNc listos para la expresión de genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA". DNA Research . 9 (3): 99–106. CiteSeerX  10.1.1.500.923 . doi :10.1093/dnares/9.3.99. PMID  12168954.
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