El pliegue BPI que contiene la familia A, miembro 3 (BPIFA3) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen BPIFA3 . [5] El gen también se conoce como SPLUNC3 y C20orf71 en humanos y el gen ortólogo en ratones es 1700058C13Rik . [6] Existen múltiples variantes de BPIFA3 que se prevé que sea una proteína secretada. [7] Se expresa muy altamente en los testículos con poca o ninguna expresión en otros tejidos. El proyecto Human Protein Atlas [8] y Mouse ENCODE Consortium [9] informan la expresión de RNA-Seq en niveles de RPKM (lecturas por kilobases de transcripción por 1 millón de lecturas mapeadas) de 29,1 para testículos humanos y 69,4 para ratones, pero 0 para todos los demás. tejidos. [5] [6] De manera similar, el consorcio Bgee, [10] que utiliza múltiples técnicas además de RNA-Seq, informa una puntuación de expresión relativa de 95,8 sobre 100 para los testículos y 99,0 para los espermatozoides en humanos; sin embargo, se observaron niveles bajos de BPIFA3 entre 20 y 30 en una variedad de tejidos como músculos, glándulas, próstata, sistema nervioso y piel. [11]
BPIFA3 es un miembro de una superfamilia de proteínas del pliegue BPI definida por la presencia del pliegue proteico bactericida/que aumenta la permeabilidad (pliegue BPI) que está formado por dos dominios similares en forma de "boomerang". [12] Esta superfamilia también se conoce como familia BPI/LBP/PLUNC o familia BPI / LPB / CETP . [13] El pliegue BPI crea bolsas de unión apolares que pueden interactuar con moléculas hidrofóbicas y anfipáticas , como las cadenas de carbono acilo de los lipopolisacáridos que se encuentran en las bacterias Gram-negativas , pero los miembros de esta familia pueden tener muchas otras funciones.
Los genes de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC se encuentran en todas las especies de vertebrados, incluidos homólogos distantes en especies no vertebradas, como insectos, moluscos y nematodos. [14] [15] Dentro de ese amplio grupo se encuentra la familia de genes BPIF cuyos miembros codifican el motivo estructural del pliegue BPI y se encuentran agrupados en un solo cromosoma, por ejemplo, el cromosoma 20 en humanos, el cromosoma 2 en ratón, el cromosoma 3 en rata, el cromosoma 2 en 17 en cerdo, cromosoma 13 en vaca. La familia de genes BPIF se divide en dos grupos, BPIFA y BPIFB. En humanos, BIPFA consta de 3 genes que codifican proteínas BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 y 1 pseudogén BPIFA4P ; mientras que BPIFB consta de 5 genes que codifican proteínas BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6 y 2 pseudogenes BPIFB5P , BPIFB9P . Lo que en los humanos aparecen como pseudogenes pueden aparecer como genes completamente funcionales en otras especies.
En humanos, el gen BPIFA3 se identificó por primera vez como un gen humano relacionado con PLUNC [16] y más tarde en ratones como 1700058C13Rik. [17] Ambos fueron reconocidos como miembros de la familia del gen BPIF y pasaron a llamarse BPIFA3 y Bpifa3 , respectivamente.
Se sabe poco sobre la función de BPIFA3. Debido a su alto grado de similitud con otros miembros de la superfamilia BPI/LBP/PLUNC, se prevé que tenga actividad de unión a lípidos como fosfolípidos y lipopolisacáridos , pero esto nunca se ha confirmado. [18]
Se ha sugerido una supuesta función de BPIFA3 en la defensa bacteriana del huésped. A pesar de una expresión casi exclusiva de BPIFA3 en los testículos, solo un informe lo implica en algún estado normal o patológico y eso involucra otitis media (OM) en el oído. [19] La OM es una enfermedad común de la primera infancia caracterizada por la inflamación de la cavidad del oído medio y se hizo un esfuerzo para identificar factores de riesgo genéticos. Se realizó un estudio de asociación de todo el genoma en el "Estudio Raine", una cohorte de nacimiento longitudinal de 2.868 niños en la que se analizaron 1.532 muestras de sangre extraídas a los 1, 2 y 3 años de edad para determinar la expresión genética correlacionada con la susceptibilidad a la OM. Inesperadamente, BPIFA3 y BPIFA1 fueron los mayores éxitos, junto con los genes CAPN14 y GALNT14 , ninguno de los cuales había sido implicado previamente en la OM. Los investigadores observaron que los miembros de la familia de genes BPIF codifican proteínas implicadas en el reconocimiento temprano de patógenos bacterianos como parte de la defensa del huésped en las entradas nasofaríngea, oral y pulmonar, y que la expresión de BPIFA3 y BPIFA1 puede ser una consecuencia lógica de la presencia bacteriana crónica en el oído lleno de pus , infectado con OM.