Hay Hominini en el registro fósil desde hace 9,5-9,0 Ma (Tortoniense, Mioceno tardío).
Al comparar el ADN los científicos han concluido que los géneros Pan y Homo tienen antepasados comunes que vivieron de cinco hasta hace siete millones de años, tras lo cual evolucionaron separadamente.
Es interesante notar que hasta ahora solamente se han encontrado algunos dientes fósiles, por lo que no se han registrado aún especies extintas del género Pan y toda la lista de extinguidas son antepasadas o están relacionadas con Homo, o están por fuera de la línea de las especies actuales.
Los cariotipos bonobo y humano difieren en 9 inversiones amplias y se han identificado 110 eventos como elementos que alteran los genes de las proteínas codificantes.
No toda la variabilidad genética resulta necesariamente en la pérdida total de un gen o su duplicación.