Género de lombrices intestinales
Caenorhabditis es un género de nematodos que viven en ambientes ricos en bacterias, como pilas de abono , animales muertos en descomposición y fruta podrida. El nombre proviene del griego: caeno- ( καινός ( caenos ) = nuevo, reciente); rhabditis = con forma de varilla ( ῥάβδος ( rhabdos ) = varilla, vara).
El género Caenorhabditis incluye al organismo modelo Caenorhabditis elegans y a varias otras especies para las que se dispone de una secuencia genómica o se está determinando actualmente. Las dos especies más estudiadas de este género ( C. elegans y C. briggsae ) son androdioicas (tienen sexos masculino y hermafrodita ), mientras que la mayoría de las demás especies son gonocorísticas (tienen sexos masculino y femenino). [2]
C. elegans es la especie tipo del género. [3] En 1900, Maupas nombró inicialmente a la especie Rhabditis elegans , Osche la colocó en el subgénero Caenorhabditis en 1952, y en 1955, Dougherty elevó Caenorhabditis al estado de género . [4]
Ecología
Los Caenorhabditis ocupan diversos ambientes ricos en nutrientes y bacterias. No forman poblaciones autosuficientes en el suelo, ya que carece de suficiente materia orgánica. Los gusanos juveniles y también las larvas de Dauer pueden ser transportados por invertebrados, incluidos milpiés , insectos , isópodos y gasterópodos . Algunas especies también parecen estar asociadas con vertebrados, incluido el ganado cebú , aunque la naturaleza de esta asociación no está clara. Las especies pueden clasificarse como " foréticas " o "necroménicas" según sus relaciones con sus huéspedes invertebrados. Un gusano forético viaja en el huésped hasta que encuentra un entorno favorable y luego se va. Un gusano necroménico espera a que el huésped muera y vive de las bacterias que prosperan en el animal muerto. Muchas especies son capaces de tener estilos de vida tanto foréticos como necroménicos. [5]
Especies
Hay alrededor de 50 especies conocidas en este género, algunas de ellas aún no descritas ni nombradas formalmente, [6] a pesar de que 15 de las especies fueron nombradas en un artículo de 2014. [7] Según la comparación de la secuencia ITS2 , estas se pueden agrupar de la siguiente manera: [7]
- Supergrupo 'Elegans'
- Grupo 'Elegans'
- Caenorhabditis elegans : genoma secuenciado en 1998 por la Universidad de Washington en St. Louis y el Instituto Wellcome Trust Sanger con una cobertura 6x [9]. Actualmente, es la especie más estudiada del género y, probablemente, del filo. Los C. elegans son en su mayoría hermafroditas protándricos XXque fertilizan utilizando su propio esperma o el esperma de machos XO ocasionales. [10]
- Caenorhabditis briggsae - secuenciación del genoma finalizada en 2003 en la Universidad de Washington en St. Louis. [11] C. briggsae es la segunda especie mejor estudiada del género. Si bien los C. briggsae también son en su mayoría hermafroditas protándricos XX, no son los parientes más cercanos de C. elegans , y la estrategia reproductiva hermafrodita de estas especies, así como de C. tropicalis , es un ejemplo de evolución convergente . La distancia evolutiva entre C. briggsae y C. elegans es similar a la de los humanos y los ratones. C. nigoni es el pariente más cercano de C. briggsae , y las dos especies pueden producir ocasionalmente híbridos algo fértiles. [12]
- Caenorhabditis remanei - genoma secuenciado por WashU GSC. [13] Más estrechamente relacionada con C. briggsae que con C. elegans , C. remanei es una especie gonocorística (obligada a tener relaciones entre macho y hembra) del grupo Elegans . En el pasado, existía cierta confusión sobre la ubicación de las cepas entre C. remanei , C. vulgaris (ahora considerada una subespecie de C. remanei ) y C. brenneri". [14]
- Caenorhabditis brenneri - (antes de 2007 denominada C. sp 4 , C. sp CB5161 y C. sp PB2801 ) - genoma secuenciado por WashU GSC. [15] Esta especie gonocorística se encuentra en elgrupo Elegans , más cerca de C. briggsae que de C. elegans . [16]
- Caenorhabditis nigoni : antes de 2014 se denominaba C. sp. 9 [7]
- Caenorhabditis doughertyi : antes de 2014 se denominaba C. sp. 10 [7]
- Caenorhabditis tropicalis - Antes de 2014 se la denominaba C. sp. 11 [7] Al igual que C. elegans y C. briggsae , las poblaciones de C. tropicalis están formadas por XX hermafroditas protándricos y X0 machos. Estas tres especies no son parientes más cercanos entre sí.
- Caenorhabditis wallacei : antes de 2014 se denominaba C. sp. 16 [7]
- Caenorhabditis latens – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 23 [7]
- Caenorhabditis sinica : antes de 2014 se denominaba C. sp. 5
- Grupo 'Japonica'
- Caenorhabditis japonica : genoma en proceso de secuenciación por el GSC de la Universidad de Wash. [17] Esta especie gonocorística se encuentra en el grupo Japonica , el clado hermano del grupo Elegans . En la naturaleza, esta especie se encuentra asociada de forma no parasitaria con la chinche excavadora Parastrachia japonensis y puede ser capaz de entrar en la etapa de Dauer independientemente de las condiciones de alimentación y hacinamiento. [18] [19]
- Caenorhabditis afra - (también conocida como C. sp. 7 , C. sp. JU1199 y C. sp. JU1286 ). Esta especie gonocórica (macho-hembra) fue aislada por Matthias Herrmann en Begoro, Ghana, África en 2007. [20] [7] Su genoma está siendo secuenciado en WashU. [21]
- Caenorhabditis imperialis – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 14 [7]
- Caenorhabditis kamaaina : antes de 2014, se conocía como C. sp. 15 [7]
- Caenorhabditis nouraguensis – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 17 [7]
- Caenorhabditis macrosperma – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 18 [7]
- Caenorhabditis yunquensis : antes de 2014, se conocía como C. sp. 19 [7]
- Supergrupo 'Drosophilae': grupo de especies que se encuentran generalmente en frutas podridas y son transportadas por moscas Drosophila.
- Caenorhabditis angaria - (antes de 2011 denominada C. sp. 2 , C. sp. 3 y C. sp. PS1010 ) [22] - genoma secuenciado en el Instituto Tecnológico de California en 2010. [23] Esta especie gonocórica, que se encuentra en el grupo Angaria delsupergrupo Drosophilae , tiene una morfología y un comportamiento distintos en comparación con C. elegans . En particular, los machos de C. angaria exhiben un comportamiento de apareamiento en espiral. Su divergencia de C. elegans es similar a la distancia entre los humanos y los peces. C. castelli es su pariente más cercano, y las dos especies pueden producir híbridos F1. [24]
- Caenorhabditis castelli – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 12 [7]
- Caenorhabditis drosophilae
- Caenorhabditis guadeloupensis – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 20 [7]
- Caenorhabditis portoensis – Antes de 2014 se denominaba C. sp. 6 [7]
- Caenorhabditis virilis : antes de 2014, se conocía como C. sp. 13 [7]
- especie Caenorhabditis 8
- basal
Otros estudios filogenéticos
El grupo de especies de Caenorhabditis se agrupa con el grupo 'Protorhabditis', que contiene especies de los géneros Protorhabditis , Diploscapter y Prodontorhabditis , por un lado, y con especies de Oscheius , por otro, para formar el grupo 'Eurhabditis' de géneros Rhabditidae . [25]
Los miembros de Caenorhabditis comparten exclusivamente 39 indeles de firma conservados que se encuentran en las regiones conservadas de varias proteínas, como la proteína Rab44 y una proteína poli ADP-ribosa glicohidrolasa (PARG-1), y se ubican específicamente en bucles expuestos a la superficie. [26] Estos marcadores moleculares ayudan a distinguir este género de todas las demás especies, y su presencia en bucles expuestos a la superficie sugiere implicaciones en las interacciones proteína-proteína o proteína-ligando. [26]
Referencias
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