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Caenorhabditis briggsae

Caenorhabditis briggsae es un nematodo pequeño, estrechamente relacionado con Caenorhabditis elegans . Las diferencias entre las dos especies son sutiles. La cola del macho en C. briggsae tiene una morfología ligeramente diferente a la de C. elegans . Otras diferencias incluyen cambios en la competencia de los precursores vulvares y la ubicación de la abertura del conducto excretor. [1] C. briggsae se utiliza con frecuencia para estudiar las diferencias entre este y el más íntimamente conocido C. elegans , especialmente a nivel de secuencia de ADN y proteínas.También se han aislado varias cepas mutantes de C. briggsae que facilitan el análisis genético de este organismo. [2] C. briggsae , al igual que C. elegans , es hermafrodita . [3] La secuencia del genoma de C. briggsae se determinó en 2003. [4]

Historia

C. briggsae fue descubierto inicialmente por Margaret Briggs en 1944. Los primeros individuos fueron aislados de una pila de hojas encontradas en el campus de Palo Alto de la Universidad de Stanford . Briggs, que estaba estudiando para su maestría, identificó a los nematodos como una especie desconocida del género Rhabditis . [5] Fueron descritos formalmente en 1949 por Dougherty y Nigon y nombrados Rhabditis briggsae . Tanto C. briggsae como C. elegans (entonces conocido como Rhabditis elegans ) fueron colocados en un nuevo subgénero Caenorhabditis en 1952. El subgénero fue posteriormente elevado a género en 1955. El trabajo inicial de Briggs con el organismo analizó su ciclo de vida en varios tipos de medios en presencia y ausencia de bacterias. Más tarde utilizó el organismo en estudios sobre los efectos de los antibióticos. Este trabajo fue importante en el desarrollo de métodos de cultivo axénico . [6]

Hábitat

C. briggsae se puede encontrar a menudo en compost, canteros de jardín, hongos húmedos o fruta podrida rica en microorganismos y diversos nutrientes. Se considera que el hábitat principal del organismo son las regiones templadas del globo, y suele acompañar a sus parientes C. elegans y C. remanei . [7]

Descripción general del genoma

El genoma de C. briggsae tiene un tamaño aproximado de 100 Mb y se predice que codifica alrededor de 20.000 genes. [8] El proyecto de secuenciación del genoma completo [9] reveló que los genomas de C. briggsae y C. elegans tienen mucho en común. Por ejemplo, ambos gusanos tienen la misma cantidad de cromosomas (seis), un tamaño de genoma similar y una cantidad similar de genes codificadores de proteínas y no codificadores de proteínas. Un análisis posterior demostró que aproximadamente el 62% de los genes codificadores de proteínas en C. briggsae tienen ortólogos en C. elegans . Sin embargo, existen muchas características específicas de especies interesantes, incluidos genes, que sirven como base para el análisis comparativo. [10]

Genómica comparativa

Esta especie se agrupa con C. nigoni en el supergrupo 'Elegans' en estudios filogenéticos.

con C. elegans

Se estima que C. briggsae es un nematodo del suelo que se separó de C. elegans hace unos 80-100 millones de años, y sin embargo es morfológicamente casi indistinguible de él. Las áreas de proteínas que codifican secuencias están mayormente conservadas entre las dos especies, mientras que la mayoría de las secuencias intergénicas e intrónicas son divergentes. Las áreas de similitud entre las secuencias de los dos organismos pueden sugerir exones codificantes o señalar regiones reguladoras y genes de ARN que no se detectan en el análisis estándar. [11]

Referencias

  1. ^ Gupta, BP; Sternberg, PW (2003). "El borrador de la secuencia del genoma del nematodo Caenorhabditis briggsae, un compañero de C. elegans". Genome Biology . 4 (12): 238. doi : 10.1186/gb-2003-4-12-238 . PMC  329410 . PMID  14659008.
  2. ^ Recurso de investigación sobre el nematodo C. briggsae
  3. ^ Haag, Eric S. (2005). "La evolución de la determinación sexual de los nematodos: C. elegans como punto de referencia para la biología comparada". WormBook: The Online Review of C. Elegans Biology : 1–14. doi :10.1895/wormbook.1.120.1. PMC 4781019 . PMID  18050417. 
  4. ^ Stein, LD; Blasiar, Darin; et al. (2003). "La secuencia del genoma de Caenorhabditis briggsae: una plataforma para la genómica comparativa". PLOS Biology . 1 (2): 166–192. doi : 10.1371/journal.pbio.0000045 . PMC 261899 . PMID  14624247. 
  5. ^ Ellsworth C Dougherty Archivado el 26 de mayo de 2008 en Wayback Machine.
  6. ^ Ferris, Howard; Hieb, WF (2015). "Ellsworth C. Dougherty: un pionero en la selección de Caenorhabditis elegans como organismo modelo". Genética . 200 (4): 991–1002. doi :10.1534/genetics.115.178913. PMC 4574257 . PMID  26272995. 
  7. ^ Watson LD; et al. (2007). "Caenorhabditis briggsae". Universidad de Washington en St. Louis . Archivado desde el original el 2010-06-01 . Consultado el 2010-03-09 .
  8. ^ "WormBase: recurso de información sobre nematodos". Archivado desde el original el 20 de abril de 2017. Consultado el 1 de junio de 2017 .
  9. ^ Stein y otros, 2003
  10. ^ Genómica y biología del nematodo Caenorhabditis briggsae
  11. ^ Proyecto C. briggsae

Enlaces externos