Elemento ARN
El elemento de ARN líder yybP-ykoY se descubrió originalmente en E. coli durante un análisis a gran escala y se denominó SraF. [1] Más tarde se descubrió que esta familia existía aguas arriba de familias relacionadas de genes proteicos en muchas bacterias, incluidos los genes yybP e ykoY en B. subtilis . Se desconocen las funciones específicas de estas proteínas, pero este elemento de ARN estructurado puede estar involucrado en su regulación genética como un riboswitch . [2] Más tarde se propuso que
el elemento yybP-ykoY respondía al manganeso después de que se demostrara que otra familia asociada de genes, YebN/MntP , codificaba bombas de eflujo de Mn 2+ en varias bacterias. [3] [4] [5] Los datos genéticos y una estructura cristalina confirmaron que yybp-ykoY es un riboswitch de manganeso que se une directamente a Mn 2+ [6] [7]
Referencias
- ^ Argaman L, Hershberg R, Vogel J, Bejerano G, Wagner EG, Margalit H, Altuvia S (junio de 2001). "Nuevos genes codificadores de ARN pequeño en las regiones intergénicas de Escherichia coli". Current Biology . 11 (12): 941–950. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00270-6 . PMID 11448770.
- ^ Barrick JE, Corbino KA, Winkler WC, Nahvi A, Mandal M, Collins J, Lee M, Roth A, Sudarsan N, Jona I, Wickiser JK, Breaker RR (abril de 2004). "Nuevos motivos de ARN sugieren un alcance ampliado para los riboswitches en el control genético bacteriano". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (17): 6421–6426. Bibcode :2004PNAS..101.6421B. doi : 10.1073/pnas.0308014101 . PMC 404060 . PMID 15096624.
- ^ Waters LS, Sandoval M, Storz G (noviembre de 2011). "El minirregulón MntR de Escherichia coli incluye genes que codifican una proteína pequeña y una bomba de eflujo requerida para la homeostasis del manganeso". Journal of Bacteriology . 193 (21): 5887–5897. doi :10.1128/jb.05872-11. PMC 3194919 . PMID 21908668.
- ^ Li C, Tao J, Mao D, He C (2011). "Un nuevo sistema de eflujo de manganeso, YebN, es necesario para la virulencia de Xanthomonas oryzae pv. oryzae". PLOS ONE . 6 (7): e21983. Bibcode :2011PLoSO...621983L. doi : 10.1371/journal.pone.0021983 . PMC 3136493 . PMID 21789199.
- ^ Veyrier FJ, Boneca IG, Cellier MF, Taha MK (septiembre de 2011). "Un nuevo transportador de metales que media la exportación de manganeso (MntX) regula la relación intracelular de Mn a Fe y la virulencia de Neisseria meningitidis". PLOS Pathogens . 7 (9): e1002261. doi : 10.1371/journal.ppat.1002261 . PMC 3182930 . PMID 21980287.
- ^ Price IR, Gaballa A, Ding F, Helmann JD, Ke A (marzo de 2015). "Mecanismos de detección de Mn(2+) de los riboswitches huérfanos yybP-ykoY". Molecular Cell . 57 (6): 1110–1123. doi :10.1016/j.molcel.2015.02.016. PMC 4703321 . PMID 25794619.
- ^ Dambach M, Sandoval M, Updegrove TB, Anantharaman V, Aravind L, Waters LS, Storz G (marzo de 2015). "El ubicuo riboswitch yybP-ykoY es un elemento regulador sensible al manganeso". Molecular Cell . 57 (6): 1099–1109. doi :10.1016/j.molcel.2015.01.035. PMC 4376352 . PMID 25794618.
Enlaces externos
- Página del líder yybP-ykoY en Rfam
