Fue renombrado como representante Permanente en 2010 y se desempeñó hasta 2014, renunciando poco antes de su elección como Alto Comisionado.

[5]​ En 2006, fue nominado por Jordania como candidato a Secretario General de las Naciones Unidas, resultado electo Ban Ki-moon.

La nominación, que posteriormente fue aprobada por los 193 Estados miembros de la ONU en la Asamblea General, lo convirtió en el primer asiático, musulmán y árabe en el cargo.

[9]​[1]​ Durante su desempeño del cargo se centró en la Franja de Gaza, Ucrania y Venezuela.

[13]​[14]​ En septiembre de 2015, Zeid criticó la intervención liderada por Arabia Saudita en Yemen.

[16]​ En septiembre de 2018 fue sustituido en el cargo por la expresidenta chilena, Michelle Bachelet.