El centro urbano está situado en una cuenca, atravesada de norte a sur por el río Fushino.

Durante el Período Muromachi el clan establece su residencia en la ciudad y potencia el comercio con la dinastía Ming.

Yamaguchi alcanza especial prosperidad de la mano de Ōuchi Yoshioki y su hijo Ōuchi Yoshitaka, y entre las personalidades históricas ligadas a la ciudad durante la época se encuentran Ashikaga Yoshitane, el décimo shōgun Ashikaga, el famoso artista de tinta china Sesshū Tōyō, y el misionero jesuita navarro Francisco Javier.

En 1551, Ōuchi Yoshitaka idea un plan para trasladar al emperador Go-Nara y a toda su corte a Yamaguchi, que es finalmente frustrado por una rebelión por parte de una facción del propio clan, lo que culmina con la caída en desgracia de los Ōuchi y su desaparición.

Durante la época Edo, Yamaguchi vuelve a florecer como zona de paso del “Hagi Ōkan”, camino que aún en nuestros días enlaza la ciudad de Hagi y la residencia del clan Mōri en Mitajiri (actual Hōfu).

En los distritos con salida al mar de Seto existen cuatro puertos pesqueros: Aio, Aibara, Ajisu y Yamaguchi.

El turismo constituye de los sectores con mayor impacto económico, recibiendo Yamaguchi 4.834.693 visitantes en 2017.

Al observar que el agua estaba templada, mandó excavar un hoyo, del cual comenzó a brotar el manantial.

Para agradecer a las deidades por estas famosas aguas se celebra cada año este festival.

El clan Ōuchi, que dominó la región entre el siglo XII y el siglo XIV, quiso reproducir la ciudad de Kioto y su vida cultural en Yamaguchi, motivo por el que se comenzó a celebrar también aquí su famoso festival de Gion.

Festival de verano con una historia que se remonta a finales del período Meiji.

La comitiva, formada por guerreros ataviados en ropajes inspirados en el período Edo, escolta el carruaje donde se transporta a la deidad.

Hoy en día se continúan elaborando en Yamaguchi, manteniendo viva esta tradición, ya que para sus habitantes esta pareja de muñecas, que representa a marido y mujer, simboliza un matrimonio feliz.