Era hijo del Conde Guillermo Mauricio I de Isenburg-Büdingen-Birstein (1657-1711) y su primera esposa, la Condesa Ana Amalia de Isenburg-Büdingen (1653-1700), hija del Conde Juan Ernesto de Isenburg-Büdingen y la Condesa Maria Carlota de Erbach-Erbach .

Su padre se casó por segunda vez en 1700 con Ana Ernestina Sofía de Kvernheim († 1708) y por tercera vez en 1709 con la condesa Wilhelmina Elizabeth von Leiningen-Dagsburg-Falkenburg-Heidesheim (1659-1733).

y la condesa del Palatinado Elizabeth Christian von Zweibrucken-Landsberg (1656-1707).

Tienen hijos: Wolfgang Ernst contrajo segundas nupcias el 27 de enero de 1719 en Marienborn cerca de Mainz con la condesa Elizabeth Charlotte von Isenburg-Büdingen-Marienborn (* 7 de noviembre de 1695; † 23 de septiembre de 1723), hija del conde Carl August von Isenburg-Büdingen-Marien (1667-1725) y Anna Belgica Florentina von Solms-Laubach (1663-1707).

Tienen dos hijas: Wolfgang Ernst I se casó por tercera vez el 22 de mayo de 1725 en Marienborn con la condesa Charlotte Amalia von Isenburg-Büdingen-Meerholz (* 1 de septiembre de 1692; † 10 de enero de 1752), viuda del conde Ernst Karl von Isenburg-Büdingen-Marienborn (16 - 1717), hija del Conde Georg Albrecht von Isenburg-Büdingen-Meerholz ( 1664-1724 ) y Amalia Henrietta von Sain-Wittgenstein-Berleburg (1664-1733).