Fue juzgado y encontrado culpable, pero luego de tres años fue indultado por el entonces presidente Richard Nixon.Calley fue asignado a la Compañía C, 1.er Batallón, 20º Regimiento, 11.ª Brigada de Infantería y pasó otro curso en Hawái antes del despacho de la brigada a Vietnam.Al segundo teniente (equivalente a alférez) William Calley y su sección le fue asignada la zona My Lai.Richard Nixon le conmutó la sentencia tres años más tarde.El juicio culminó con la absolución del capitán Ernest Medina, quien estaba a cargo de la Compañía, y de otros 29 oficiales que habían sido juzgados.