Goggins nació en Alabama y se crio en Lithia Springs, Georgia, donde su abuela regentaba la oficina de correos local.

Cuando tenía diez años, Goggins y su madre fueron los campeones estatales de baile con zuecos.

Cuando B. B. King estuvo de gira, Goggins y su madre abrieron un concierto para él en la prisión del condado de Fulton, en Atlanta.

Fue productor del cortometraje de 2001 The Accountant, el cual consiguió un Óscar al mejor corto de acción en vivo y, aunque no estaba oficialmente apuntado como ganador, subió al escenario durante la ceremonia de entrega a recoger el premio junto con Ray McKinnon y Lisa Blount.

En una entrevista tras las cámaras de la serie The Shield, Walton Goggins reconoce que cuando se mete en su personaje del detective Shane Vendrell se transforma en él para el resto del día.