Comenzó en las inferiores de Junior pero su riqueza técnica hizo que rápidamente fuera transferido al equipo filial de este, el Barranquilla FC, en este equipo jugó 25 partidos en 2007, en la Primera B, manteniendo un rendimiento parejo.

Ya con Julio Comesaña como técnico fue llamado para que hiciera parte de la plantilla principal del Junior.

El 2 de julio de 2021 llegó a Independiente Medellín proveniente del cásico rival; Vladimir estuvo en el equipo 'Poderoso' durante 3 temporadas, donde jugó 83 partidos entre Categoría Primera A, Copa Colombia y Copa Sudamericana; marcó 8 goles y dio 11 asistencias.

En su segundo paso por el club barranquillero, 'Vlacho' jugó 61 partidos, marcó 4 goles y dio 3 asistencias.

Con 'Los Cardenales', Hernández debutó el 21 de agosto en el partido válido por la 6ta jornada del primer semestre de la Liga Betplay Dimayor 2024 donde enfrentó a Deportivo Cali en el Estadio Deportivo Cali y con el resultado a favor 1-3.

Durante el semestre, Vladimir únicamente jugó 2 partidos, esto debido a que tuvo una lesión en su pie derecho.