Fue fundado en 1975 y desapareció en 2004, tras haber vivido su época dorada en los años 1990, cuando participó en Tercera División.
El Vilobí CF se fundó en 1975,[2] impulsado por Josep Panella, inicialmente jugador del equipo y a partir de 1980 presidente, cargo que ocupó un cuarto de siglo, hasta la disolución del club.
[3] Durante sus primeros años el Vilobí vivió en las divisiones regionales del fútbol catalán, hasta que la temporada 1989/90, como campeón de Preferente, ascendió a categoría nacional.
La temporada 1991/92 realizó su única participación en la Copa del Rey en la que, tras superar al Girona FC, cayó en la segunda eliminatoria ante la UE Sant Andreu.
La temporada 2000/01, tras perder la categoría, el club anunció la disolución del primer equipo -que debía jugar en Primera Catalana-, quedando únicamente en activo sus equipos de fútbol base, incluyendo un juvenil en la máxima categoría, la División de Honor.