De este modo, Thou Shalt Suffer continúa hasta hoy en día con Ihsahn como único miembro.
Tres años después, Ihsahn formó el grupo de avant garde metal Peccatum junto con su mujer Heidi Tveitar (conocida como Ihriel).
El último álbum de Emperor, Prometheus: The Discipline of Fire & Demise, salió al mercado en 2001, y fue compuesto totalmente por Ihsahn.
Este álbum presenta una orquestación más compleja, y una reducción en el uso del sintetizador.
Todos los instrumentos fueron grabados por él, excepto la batería, que corrió a cargo de Asgeir Mickelson.