Así nació el Valletta FC, que contaba con directiva, cuerpo técnico y jugadores de los dos clubes anteriores.
Para el fútbol maltés el Valletta FC es uno de los equipos que más títulos han ganado con buenas rachas en las décadas de 1960 y 1970, si bien los principales dominadores del campeonato liguero eran Sliema Wanderers y Floriana FC.
En la 2000-01 consiguieron un histórico triplete al vencer en Liga, Copa y Supercopa maltesas.
El Valletta FC juega sus partidos como local en el Estadio del Centenario, situado en la cercana ciudad de Ta' Qali.
Ta'Qali es donde también juega la selección nacional, aunque lo hacen en el Estadio de Ta' Qali, con mayor capacidad.