Desde sus inicios y hasta las primeras elecciones del año 2019 la Universidad fue dirigida por 5 rectores organizadores: la Dra.
Jorge Raúl Olguín, el Dr. Roberto Schwartz y el Dr. David Luciano Rivarola.
A fines del año 2009 se creó la UNViMe por ley N.º 26.542.
En una votación unánime en el Senado de la Nación se declaró el repudio a la intervención que ha realizado el Poder Ejecutivo Nacional a la Universidad Nacional de Villa Mercedes.
[6] La senadora nacional por San Luis Negre de Alonso aseguró que es “es un avasallamiento al orden institucional y a la autarquía universitaria”.