Empezaron a funcionar como organismos académicos las facultades de Agronomía y Zootecnia.

El año 2000, inicia sus funciones académicas la Facultad de Ingeniería en Informática y Sistemas.

Los recursos bibliográficos, están organizados en colecciones temáticas que corresponden al campo del conocimiento que abarca la formación académica que brinda la universidad a través de las carreras profesionales y los estudios de posgrado, además contamos con biblioteca virtual con más de 60 mil títulos a texto completo.

Impartir a sus estudiantes conocimientos, destrezas, valores y hacerlos competitivos para su ingreso a la UNAS u otras Universidades del país, además de brindarles sólida formación académica que les permita desenvolverse con éxito en las diferentes etapas de su vida universitaria, profesional y personal.

Del total de 92 universidades licenciadas en el Perú,[2]​ la Universidad Nacional Agraria de la Selva se ha ubicado regularmente dentro del tercio medio a nivel nacional en determinados rankings universitarios internacionales.

El doctor honoris causa es la más alta distinción académica que confiere una casa superior de estudios.