Permaneció allí hasta 2003, cuando una victoria ante su rival US Bressane en semifinales le permitió acceder a la segunda división profesional del rugby francés, el campeonato Pro D2 .

La estadounidense Oyonnax valida definitivamente su billete a la élite durante la 27 jornada del Pro D2 en Brive, donde el club consigue el último punto necesario.

Tras el descanso, con el ensayo de Hemani Paea, fue finalmente el joven pilar del Toulouse Cyril Baille quien marcó el ensayo de la victoria para el Stade Toulousain en el 74 minuto, pese al acierto a pie del goleador oyonnaxiano Benjamín Urdapilleta .

El descenso se hizo oficial al caer con fuerza en el terreno de juego del Stade Français (69-8).

Estos resultados permiten a USO coronarse campeón de Francia Pro D2 por segunda vez en su historia y obtener su billete directo al Top 14.

El US Oyonnax perdió ante el FC Grenoble por 22 à 47 en el partido de play-off para el ascenso al Top 14 [8]​ y sufrió otro descenso.

[9]​ [10]​ Al año siguiente, Oyonnax Rugby terminó segundo en la temporada regular, pero perdió en la semifinal (34-38) ante el futuro campeón francés, Aviron Bayonnais.

Para su primera temporada, el club se fortaleció reclutando a los internacionales Josh Tyrell, Lionel Beauxis y Pedro Bettencourt .

Al año siguiente, en 2021, el club se fortaleció reclutando a muchos internacionales, entre ellos Manu Leiataua, Luke Hamilton, Josh Strauss, Chris Feauai-Sautia, Gabiriele Lovobalavu, Taylor Paris y Benjamin Fall.

En 2022, Oyonnax mejoró su posición y terminó tercero en Pro D2 al final de la temporada regular, clasificándose así a los play-offs contra Colomiers .