Durante algún tiempo tuvieron bajo control la mayor parte del territorio somalí no perteneciente a las autoproclamadas como independientes Puntland y Somalilandia, en el norte, y le apoyaba una vasta mayoría de su población, incluyendo la capital de Somalia, Mogadiscio, y muchas de las mayores ciudades del país (Jowhar, Kismaayo, Beledweyne, etc.).

Sólo las más lejanas regiones interiores del sur estaban fuera de su control.

Somalia es un país enteramente musulmán, y sus instituciones tienen un gran apoyo público.

Los primeros años de los tribunales incluyeron equipos como Sheikh Ali Dheere, establecido en la ciudad norteña de Mogadiscio en 1994 y la corte Beled Weyene iniciada en 1996.

Pronto vieron el sentido del trabajo a través de una comisión mixta para promover la seguridad.

En el año 2000, las cortes formaron una unión de cortes islámicas, en parte para consolidar recursos y poder, y en parte para ayudar a terminar con las decisiones de los clanes.

Esto significó un gran cambio, ya que esos señores de la guerra habían venido luchando entre ellos durante varios años.

Sin embargo oficiales estadounidenses confirmaron anónimamente que el gobierno estaba financiando a la ARPLT, debido a la posibilidad de que la UCI esté relacionada con al-Qaeda y que esté protegiendo a tres líderes de la organización terrorista envueltos en pasados ataques, incluido el bombardeo de las embajadas de Estados Unidos en Kenia y Tanzania en 1998.

A los señores de la guerra se les ofreció dejar la ciudad o ser capturados.

Esta fuerza ahora tiene bajo su control mucho del armamento del país lo que hace difícil el resurgimiento de los señores de la guerra, a menos que fuerzas exteriores intervengan.

Las fuerzas etíopes no se retiraron, y el tratado acordado quedó sin efecto.

La Unión de Cortes Islámicas aceptan no permitir que nadie cree violencia en Mogadiscio y que cualquiera que sea encontrado culpable será llevado ante la ley y se le aplicará el castigo conveniente según la Sharia Islámica.