[2] En eucariotas, el término translocón se refiere comúnmente al complejo que transporta polipéptidos nacientes con una secuencia de señal (partícula de reconocimiento de señal, SRP) en su interior (cisternal o luminal) del retículo endoplásmico desde el citosol.
El elemento central es el propio canal de translocación, el heterotrímero Sec 61.
[5] Las proteínas para ser trasladadas al RE son reconocidas por la partícula de reconocimiento de señal, que detiene la traducción del polipéptido por el ribosoma.
Este evento de reconocimiento se basa en una secuencia específica de la señal N-terminal que se encuentra en los primeros codones del polipéptido al ser sintetizados.
El polipéptido emergente pasa a través del canal como una cadena no plegada de aminoácidos (estructura primaria).Una vez que la traducción ha terminado una señal peptidasa corta la proteína naciente dejando el polipéptido libre en el interior del RE.