Jugaron solamente dos años, en 1967 en la National Professional Soccer League (NPSL) y en 1968 en la North American Soccer League (NASL).
Debido a una mala estrategia financiera, los Toronto Falcons tuvieron que cerrar tras solo dos temporadas.
Su rival de la misma ciudad, el Toronto City, tuvo un destino similar y solo duró un año.
La temporada siguiente, la NPSL se fusionó con la North American Soccer League y los Falcons cambiaron de liga.
En la NASL, con el legendario Ladislao Kubala como entrenador, los Falcons jugaron bien recogiendo un resultado de 13 partidos ganados, 13 partidos empatados y 6 partidos perdidos, pero los problemas económicos hicieron que el club cerrara sus puertas para siempre.