El Millennium Estoril Open 2016 fue un torneo de tenis jugado en tierra batida al aire libre que se celebró en Estoril, Portugal, del 25 al 30 de abril de 2016.

Fue la 2ª edición del Millennium Estoril Open, y fue parte del ATP World Tour 250 series del 2016.

Nicolás Almagro venció a Pablo Carreño Busta por 6-7(6), 7-6(5), 6-3 Eric Butorac / Scott Lipsky vencieron a Łukasz Kubot / Marcin Matkowski por 6-4, 3-6, [10-8]