Su lugar fue ocupado, según lo establecido en el reglamento, por Independiente Rivadavia, mejor ubicado en la tabla general acumulada.
Guillermo Brown de Puerto Madryn se consagró campeón y obtuvo el derecho a disputar la final por el ascenso.
Independiente Rivadavia se consagró campeón y obtuvo el ascenso a la Primera B Nacional.
Guillermo Brown obtuvo el derecho a jugar la promoción, en la cual cayó derrotado por un marcador global de 4-0 ante Sportivo Ben Hur.
El primero involucró a Central Norte y 9 de julio, que se enfrentaban en la última fecha del Torneo Clausura 2007.
Para el primer equipo, que actuaba como visitante y había resultado campeón del Torneo Apertura 2006, una derrota implicaba, debido a su pésima actuación en el Clausura, caer en zona de promoción, lo cual no sólo significaba perder el derecho a jugar la final por el ascenso al Nacional B sino también la posibilidad de descender al Torneo Argentino B.
Días después, Juventud Unida presentó una queja y, con posterioridad, un video en el que se veía a León Bustos, jugador de San Martín, admitiendo que el equipo sanjuanino les había ofrecido un incentivo de $30.000 para no ganar el partido.