Se jugó en modalidad mexicana, es decir, se jugó una Fase Clasificatoria, en donde los 18 equipos se enfrentaron todos contra todos en una sola rueda, y una Etapa de Eliminación Directa (play-offs) en partidos de ida y vuelta, para definir al campeón.
La diferencia con años anteriores consiste en la forma de clasificación a la Etapa de Eliminación Directa, que adaptará el sistema colombiano, en el que los 8 primeros de la tabla en la Fase Clasificatoria accedieron a las fases finales del campeonato.
Esta es la lista de todos los árbitros disponibles que pudieron dirigir partidos este torneo.
La novedad para esta temporada fueron Francisco Caamaño y Carlos Ulloa (quien arbitrara por primera vez en Primera División), reemplazando a José Henríquez, que arbitrara en Primera B para la temporada 2008, y Rubén Selmán, que se retiró del referato.
El ganador fue este último equipo, que obtuvo el segundo cupo para la Copa Sudamericana 2009.