Su formato fue muy similar al de Cartoon Network, Disney Channel y Nickelodeon en sus inicios.

Durante el primer año del canal, un bloque de programas de Toon Disney era emitido en Disney Channel los domingos por la noche, como un avance o "preview" del canal para suscriptores interesados.

Muchos programas del bloque sabatino Disney's One Saturday Morning emitido en ABC, tales como Recreo, 101 dálmatas: la serie, Lloyd del Espacio y Pepper Ann se unieron a Toon Disney, la mayoría sin sacarles espacio a los programas viejos.

El canal tenía versiones en Escandinavia, Italia, India, Japón, Israel, España y Reino Unido.

La versión 3D del logotipo sólo se utiliza en bumpers, promos y comerciales.