Tomasz Kiendyś debutó como profesional en 2001 con el equipo Mikomax.

Con este equipo ganó la carrera por etapas polaca Szlakiem Grodów Piastowskich en 2006, gracias a su victoria en la contrarreloj de la segunda etapa.

Debido a estos resultados, fichó por el equipo CCC Polsat Polkowice.

Con este equipo ganó la Szlakiem Grodów Piastowskich por segundo año consecutivo.

Ganó el prólogo de la Flèche du Sud en 2007 en Luxemburgo, donde terminó segundo.