A principios de los años 1990 Green tuvo una fugaz carrera como rapero en la banda Organized Rhyme.
En 1993 se emitió por primera vez en el canal público de Ottawa Rogers Community 22 The Tom Green Show, su espectáculo cómico, que pasaría posteriormente a Comedy Network, para en 1999 trasladarse a Estados Unidos, siendo emitido por MTV hasta su cancelación en el año 2000.
La fama lograda con este programa le ayudó a abrirse camino en el mundo del cine estadounidense como actor secundario, por ejemplo en Road Trip, y como actor principal, director y guionista en Freddy Got Fingered, película con la que cosechó cinco Razzies (conocidos como los "anti-Óscar"), ganándose un amplio público entre los adolescentes.
Tras diagnosticársele un cáncer testicular en marzo de 2000, grabó un documental sobre su enfermedad, incluida la operación a la que fue sometido, recibiendo numerosas críticas positivas y resultando muy aclamado entre las organizaciones estadounidenses de cáncer por su carácter educativo.
El 25 de diciembre del 2003 Tom Green contrajo nuevamente matrimonio con la modelo Natalie Sparks.