Hace trece años en el calendario de la Nueva Era Común (新西暦, Shinseireki?
), la computadora que controlaba la nueva fuente de energía recién descubierta llamada Enetron (エネトロン, Enetoron?)
fue infectada por un virus que la hizo crear a la entidad maligna conocida como Messiah, que desea conquistar a la humanidad y crear un mundo para las máquinas.
En la actualidad, una misteriosa figura llamada Enter lidera a un grupo llamado Vaglass en incursiones en el mundo real para conseguir el suficiente Enetron para traer de vuelta a Messiah.
): Es una organización que pretender hacer a la Tierra un lugar más agradable para las máquinas, y que busca destruir a la raza humana haciéndose con el Enetron.