[2]​ Inicialmente anunciado para Nintendo 3DS, Level-5 anunció en octubre de 2011 que el juego también saldría a la venta para PlayStation Portable y PlayStation Vita.

Un día en particular en el año 2013, un agujero misterioso, llamado "Hole Lost" (Agujero Perdido), surgió del cielo, y junto con él, llegó una enorme explosión que devastó la zona central de Tokio y se cobró la vida de muchas personas.

Dieciocho años más tarde, el 28 de abril de 2031, en una metrópoli recién reconstruida, un nuevo evento está a punto de ocurrir, el cual podría cambiar el destino del mundo para siempre.

El juego tiene lugar en una zona central de Tokio reconstruida.

Este edificio en particular es lo que alimenta la ciudad, aunque cómo es capaz de generar energía es un misterio.