Thomas Kleine (Wermelskirchen, Alemania Occidental; 28 de diciembre de 1977) es un exfutbolista y entrenador alemán, que se desempeñaba como defensa.

[1]​ Thomas Kleine inició su carrera en 1998, jugando por el Bayer Leverkusen II (que es el equipo filial, del club de las aspirinas), donde jugó hasta el primer semestre del 2001.

En el 2003, tuvo su primer ciclo en el Greuther Fürth, donde se mantuvo hasta el 2007.

Luego fue traspasado al Hannover 96, donde estuvo tanto en el equipo filial como en el estelar.

Después del Mundial, volvió nuevamente al Greuther Fürth, para su segundo ciclo en el club.