[1]​ Con una longitud de 70 centímetros, igual que una gacela, Thoatherium fue el representante de menor tamaño conocido del orden Litopterna.

Debido a sus largas patas, seguramente era un poderoso corredor.

Thoatherium tenía una notable reducción de los dedos de las patas; en realidad, sólo poseía una gran pezuña en cada una, de manera similar a los modernos caballos.

Thoatherium incluso carecía de los huesos de la férula, los cuales son los remanentes del segundo y el cuarto dedo en los caballos actuales.

Dado que poseía dientes de apariencia generalizada, Thoatherium probablemente consumía hojas y otra vegetación suave más que comer pastos.