En el caso, del modo Extra, este incluye todas las características de las dos primeras versiones con base principalmente en KOF '94.

Para comenzar, ahora la barra de POW ya no se carga voluntariamente.

Cuando se tiene más de un Stock y se pulsa A+B+C al mismo tiempo, aparecerá una barra de POW que actuará del mismo modo que si tenemos la barra de POW al máximo en los primeros dos juegos con todas sus características y como adición, si tenemos otro stock y realizamos un Desperation move, tendremos su versión super disponible tal como si tuviéramos la barra de vida parpadeando en rojo y el POW en MAXIMUM en la anterior entrega, además de que no perderemos la barra anteriormente mencionada permitiéndonos realizar otro Super Desperation Move mientras dure la barra activada.

El torneo comenzó y, curiosamente, Kyo e Iori no luchan en esta oportunidad.

Durante el torneo, el "New faces team" junto con Leona e Iori desaparecen misteriosamente.

Algunos equipos desaparecen respecto al juego del 96, y en otros se cambian de integrantes:

Tras esta pelea, Kyo desaparecería, e Iori va en su búsqueda durante dos años, hasta el torneo de 1999.