Empezó a jugar en el equipo juvenil del Tokyo Verdy 1969 y debutó en la J1 League con solo 16 años.

En julio de 2006 pasa al Catania Calcio de Italia, equipo que consiguió el ascenso a la Serie A.

Marca su primer gol contra el JEF United Ichihara el 5 de mayo del mismo año, 2 días antes de cumplir 16 años, realizando otro récord en la J. League.

[cita requerida] Jeremy Walker, experto de fútbol japonés, comparó a Morimoto con Ronaldo al principio de su carrera, según él se parece al brasileño por constitución física, fuerza y rapidez.

Unos aficionados del Catania le dedicaron una página web, la primera en internet, llamada MorimotoMania.com donde se encuentran todas las informaciones sobre el fenómeno japonés.