Sus obras Ping Pong y Aoi Haru fueron adaptados a películas en imagen real.

En 1986, cuando tenía 18 años Matsumoto hace un viaje a Francia que le resultaría de gran importancia en su carrera.

En 1987 queda finalista en el Premio Cuatro Estaciones de la Afternoon para aspirantes a mangaka con la historia corta STRAIGHT.

A principios de los año 90 publica en la Big Comics Spirits obras como ZERO, Hanaotoko y Tekkon Kinkreet, siendo esta última su primer gran éxito, y consiguiendo con ella, varios años después, su primer premio Eisner, así como una adaptación a película de animación por Michael Arias.

En 2020 vuelve a colaborar con el guionista Issei Eifuku en otra serie de corte histórico llamada Mukashi no Hanashi.

También ha citado a Frank Miller como una fuerte influencia en su uso del blanco y negro en Ping Pong.

3 años después, en 2008, Glénat/EDT publica Tekkon Kinkreet en un formato que recopila los tres volúmenes originales en uno solo.

Sin embargo, la serie resulta un fracaso en España y los últimos volúmenes terminan saliendo con una tirada muy reducida.

Entre sus familiares se encuentran su primo Santa Inoue, otro reconocido mangaka, su madre, la poeta Naoko Kudō, y su mujer, la mangaka Saho Tono, que ocasionalmente le ayuda en su trabajo y le proporciona asistencia editorial.