Ōkubo trabajó primero en física de partículas.
[2][3] Ōkubo comenzó a estudiar en la Universidad de Toquio en 1949 y recibió el título allí en 1952.
Se graduño como estudiante en la Universidad de Rochester en 1954, donde consiguió el título en 1958 con David Feldman como profesor de la tesis.
[1] Después de ello, obtuvo el postgrado en 1959/60 en la Universidad de Nápoles, en 1960/61 en CERN, y después en 1962 comenzó la investigación nuevamente en la Universidad de Rochester, donde se convirtió en profesor en 1964 y se retiró en 1996 como profesor emérito.
[4] En 1976 Ōkubo recibió el Premio Memorial Nishina en Japón y en 2006 la Medalla Wigner.