Las oficinas centrales de Supermicro están ubicadas en Silicon Valley, con operaciones globales que se expanden a un espacio de fabricación en los Países Bajos y un Parque Científico y Tecnológico en Taiwán.Al final del año fiscal, Supermicro empleaba a más de 800 empleados de tiempo completo en todo el mundo, incluyendo 655 en San José.Durante el tiempo que sirvió como sede del Mercury News, el edificio principal fue ampliado de 17.200 m² (185.000 pies cuadrados) a 29.000 m² (312.000 pies cuadrados).La logia se distingue por una serie de columnas metálicas y el foso que la rodea.[11] En 2014 el superordenador TSUBAME-KFC del GCIC Center Tokyo Institute of Technology, de Supermicro, fue el primero en la lista Green 500.
