La Subsecretaría de Transporte es una de las subsecretarías más importantes de la Secretaría de Comunicaciones y Transportes (México), de la cual dependen la Dirección General de Aeronáutica Civil, La Dirección General de Autotransporte Federal, La Dirección General de Protección y Medicina Preventiva en el Transporte y La Dirección General de Transporte Ferroviario y Multimodal.
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