Gracias a estos buenos resultados, fue seleccionado en el equipo nacional para el Campeonato del Mundo en Verona, con el líder Erik Zabel.

Sus victorias en la Ster Elektrotoer, la Vuelta a la Baja Sajonia y la Vuelta a Renania-Palatinado, y muchos lugares de honor le permitió terminar en el tercer lugar de la primera edición del UCI Europe Tour Ranking.

A pesar de un verano sin competición, por su ejecución en la primavera le permió firmar en noviembre un contrato de tres años con el equipo alemán Gerolsteiner, donde se unió a sus compañeros en otros equipos Volker Ordowski y Matthias Russ.

Al mes siguiente, ganó el Circuito de la Sarthe y luego hizo noveno en la Amstel Gold Race.

Gana la cuarta etapa contra el reloj y captura la maglia rosa, se mantuvo dos días.

Consiguió el tercer lugar en la etapa y ganó el evento con un segundo por delante de George Hincapie.

En septiembre, Stefan Schumacher gana su segunda vuelta en la carrera ProTour, el Tour de Polonia.

Su lesión, lo que requiere doce puntos de sutura, le mantiene cuatro días sin poder hacer nada.

Su primera gran cita, tendrá lugar en junio, ya que Stefan Schumacher debe participar en su primer Tour de Francia.

Después de un decimoquinto lugar en la etapa cronometrada, completó el Tour en 87.ª posición en la clasificación general.

Hace una buena contra reloj y, a continuación, en la decimocuarta etapa, forma parte en la escapada de un grupo de once corredores que llegan a Villacarrillo con diez minutos por delante del resto, pero ocupa el tercer lugar.

Fabian Wegmann, compañero de equipo, tanto a escala nacional como en el equipo Gerolsteiner, funciona eficazmente como en la Amstel Gold Race y trae el grupo del líder a Davide Rebellin y Alexandr Kolobnev.

Coincidiendo con esta controversia, Stefan Schumacher causa un accidente de tráfico, durante el cual se incrusta en un jardín vallado.

En 2012 fichó por el Christina Watches-Onfone de Dinamarca, donde se encontraban entre otros Michael Rasmussen y Angelo Furlan.

Entre las sustancias que reconoció haber consumido se encuentran EPO, hormona del crecimiento y cortisona.