En 1930, durante la presidencia del general Pascual Ortiz Rubio, fue designada como Academia Nacional de Ciencias “Antonio Alzate”.
Fueron apoyados por los maestros de la Escuela Nacional Preparatoria Mariano Bárcenas, Miguel Pérez, Rómulo Ugalde, Ramón Monterola y Alfonso Herrera Fernández.
[1] En su sede se estableció una biblioteca con ejemplares de historia natural e instrumentos científicos.
El objetivo de la Sociedad era difundir tanto las ciencias científicas como las humanísticas en el país, así como relacionarse con otras sociedades en todo el mundo.
[2] Algunos de sus miembros fueron Alberto María Carreño (presidente), Joaquín de Mendizábal y Tamborrel (presidente), Agustín Aragón (presidente honorario vitalicio), Sotero Prieto Rodríguez, Isaac Ochoterena, Ezequiel Ordóñez, Miguel E. Schulz, Carlos Graef Fernández, Primo Feliciano Velázquez, Jesús Galindo y Villa, José Ignacio Dávila Garibi, Miguel Salinas Alanís, Fulgencio Vargas, Porfirio Parra, Jesús García Gutiérrez, Francisco Pérez Salazar y de Haro, Fridiano Cavara (miembro honorario), Giuseppe Lopriore (miembro honorario), Alfonso Caso y muchos otros.