Tuanku Syed Sirajuddin nació en Arau, Perlis, el segundo de diez hijos de Almarhum Tuanku Syed Putra Jamalullail y Tengku Budriah binti Almarhum Tengku Ismail.
Tuanku Syed Sirajuddin comenzó su educación secundaria en la escuela libre de Penang en 9 de enero de 1956 y más tarde se fue a Inglaterra para estudiar en la Wellingborough School durante cuatro años hasta 1963.
Se formó como oficial cadete en la Royal Military Academy en Sandhurst, Inglaterra, desde enero de 1964 hasta diciembre de 1965.
Luego sirvió en Pahang durante varios años hasta que renunció el 31 de diciembre de 1969 para regresar a Perlis.
Esto fue antes de lo esperado porque el Sultán de Selangor y el anterior 11.º Yang di-Pertuan Agong, Almarhum Sultan Salahuddin Abdul Aziz Shah Al-Haj ibni Almarhum El sultán Sir Hisamuddin Alam Shah Al-Haj, murió el 21 de noviembre de 2001, mientras que su mandato debería haber terminado en 2004.