[cita requerida] La meditación es una práctica común de todas las escuelas del budismo.
[cita requerida] El Shinnyo-en tiene su propia forma exclusiva de meditación, llamada sesshin.
Se realiza con la ayuda de otros seguidores que han entrenado lo suficiente como para ser guías espirituales (reinoshas) y durante la meditación actúan como espejos espirituales para los aprendices.
Antes del discurso, se disponen luces y flores frente a la imagen de Buda.
Según sus practicantes, el sesshin ayuda a las personas a mirar en su interior y así deshacerse de la codicia, ira e ignorancia que les nubla su naturaleza (también ver Nirvana-sutra y Buddha-dathu).