Con esta nueva tecnología en su control Sentinel Prime y los Autobots logran ganarle la batalla a Los Decepticons.

Megatron por su lado también toman ventaja de esa misma tecnología y logran desarrollarla debido a su potente armamento en Artillerías.

Sin Embargo The Fallen crea al Robot-Smasher un robot que podía convertir a cualquier Autobot o civil en un sumiso Decepticon (Más adelante ese mismo robot hizo a los Constructicons sumisos ante estos líderes Decepticons y The Fallen los modifica a los Constructicons el modo Gestalt de Devastator, quien luego querían que este mismo robot convirtiera a Omega Supreme en otro sumiso Decepticon pero este no se dejó y eliminó al Robot-Smasher (instantáneamente).

Megatron y The Fallen se vuelven más poderosos y se enfrentan a Sentinel Prime y sus Autobots, Sentinel Prime arremete contra Megatron y queda gravemente herido, Alpha Trion un exlíder Autobot que estaba en las cercanías intenta ayudar a Sentinel Prime, pero este mismo sabe que su fin está próximo, así que se levanta un poco e inmediatamente le entrega a Alpha Trion la matriz de liderazgo con la que logra detener a The Fallen y otros Decepticons, usando el poder de la misma y su iluminación, logra hacer que The Fallen fuese exiliado a un rumbo o dimensión desconocida, sin saber nada de su paradero, mientras tanto, Sentinel Prime que agonizaba, le encarga a Alpha Trion que proteja la matriz de liderazgo Autobot, Sentinel Prime muere y la matriz debe entregarse a su sucesor, al próximo Prime, Alpha Trion lo entiende y la esconde para evitar que caiga en manos de los Decepticons.

Cuando hicieron una exploración por buscar más energon se fueron a un planeta orgánico lleno de arañas, junto con Elita-1 .

Ella aparentemente muere en este planeta, pero nadie se imaginó que estaba viva y convirtiéndose en una Decepticon llamada Blackarachnia.

Curiosamente Sentinel Prime en esta serie fue inspirado en The Tick (La Garrapata) incluso el diseño, color e incluso la voz (Townsend Coleman) quien le da al personaje.

El actor estadounidense de culto, Leonard Nimoy, le prestó su voz al personaje.

Durante la película, los Autobots descubren una pieza del Arca (la nave de los Autobots) en Ucrania la cual la tenía Shockwave con la ayuda de su "mascota" Driller ambos intencionadamente les dan a conocer el paradero del Arca, sin embargo Optimus Prime le pide a los líderes terrestres una explicación del porqué no le habían dicho que ya conocían de la existencia del Arca y su ubicación; un astronauta que pisó la luna en el año 1969 (Buzz Aldrin) le comenta que el Arca (en la cual estaba Sentinel Prime) estaba situada en el lado oscuro de la luna.

Los humanos no perdieron tiempo en llegar a un acuerdo, y el Xantium fue lanzado con los nueve Autobots restantes de la Tierra dentro, con lo que Starscream hizo volar la nave en pedazos.

Por otro lado, Optimus Prime le dispara al pilar de control con el cañón de Shockwave, desactivando el puente, llevando a un furioso Sentinel Prime a encararlo en una feroz batalla una vez más.

Además, aparece una foto de Sentinel Prime con una X roja que indica su muerte en la película anterior.