El Seminario Evangélico de Puerto Rico (SEPR) es un seminario protestante interdenominacional ubicado en San Juan, Puerto Rico, que ofrece estudios de grado en Maestría en Divinidad (MDiv), Maestría en Artes en Religión (MA) y Doctorado en Ministerio (DMin).
Este seminario está actualmente patrocinado por las Iglesias Bautistas de Puerto Rico, la Iglesia Evangélica Unida de Puerto Rico, el Sínodo del Caribe de las Iglesias Evangélicas Luteranas, la Iglesia Metodista de Puerto Rico, el Sínodo Presbiteriano Boriquén en Puerto Rico y la Iglesia Cristiana (Discípulos de Cristo) en Puerto Rico.
El seminario ha mantenido sus enlaces con la Iglesia Unida de Cristo aun cuando la IEUPR los ha cortado con ella.
En 1930 el seminario adquirió el terreno que hoy ocupa y ya para 1935 todas las actividades se realizaban allí.
El SEPR ofrece actualmente tres programas de postgrado: Maestría en Divinidad (MDiv), Maestría en Consejería en Familia, Pareja y Matrimonio (MAFPM) y Maestría en Artes en Religión (MA).