En la segunda ronda se enfrentó a Ghana y sorprendió al empatar 0-0 en la ida, pero perdió 2-0 en la vuelta.
Comoras tiene menos de 900 mil habitantes y cuenta con tres islas principales.
Esos fueron sus únicos partidos jugados, hasta las eliminatorias para la Copa de Naciones Árabe 2009 celebradas en el 2006.
Desde entonces, los resultados han mejorado constantemente, incluidas las victorias en casa contra Botsuana, Mauricio y Malaui en las eliminatorias para la Copa Africana de Naciones 2019.
El 14 de noviembre de 2019, Comoras abrió su campaña de clasificación para la Copa Africana de Naciones 2021 con una victoria por 0-1 ante Togo, su primera victoria a domicilio ante una clasificación importante, continuaron con un importante empate ante Egipto, seguirían su racha invicta con un empate y victoria ante Kenia, otro empate ante Togo y una derrota aglomerada ante Egipto, clasificándose así a su primer gran torneo desde que se unieron a la FIFA.