La ZMW permite el estudio de un único nucleótido incorporado a la polimerización.
Cada una de las cuatro bases nitrogenadas del ADN se marca con un fluoróforo diferente.
Con un nuevo kit comercial a principios de 2012 se consiguió incrementar dicha cifra hasta 2,5-2,9 kb.
[7] A finales del mismo año, un kit XL aumentó el valor hasta más de 4,3 kb.
[12] En abril de 2013 la compañía comercializó una nueva versión del secuenciador (PacBio RS II) que usa las 150000 ZMW a la vez, duplicando así el rendimiento.
El rendimiento varía según el tipo de muestra que se secuencia.