[4]​ El 20 de julio de 1989, y por decreto 355/89 del presidente Carlos Menem, se modificó la estructura del Ministerio de Economía y la Secretaría de Minería desapareció.

[6]​Un año después aquella subsecretaría pasó a ser una secretaría.

[8]​[9]​A fines del año 1995, cuando el Ministerio de Economía realizó varias reestructuraciones para reducir el número de Secretarías de Estado que tenía, Carlos Magariños, que tenía a su cargo la Secretaría de Industria desde 1993, fue designado Secretario de Minería e Industria de la Nación.

[8]​[10]​ En 2019, durante la presidencia de Alberto Fernández, se creó la Secretaría de Minería nuevamente, abandonando el nombre de Secretaría de Política Minera que tenía hasta entonces.

Desde su creación, formó parte del Ministerio de Desarrollo Productivo hasta la disolución del ministerio en 2022, momento en el que pasó a formar parte de la estructura secretarial del Ministerio de Economía.