[1]​ La fe cristiana de Raymundo Cedeño, uno de los primeros habitantes de la región, hacía celebraciones en honor al santo San Jacinto, y es en el año de 1965 en una reunión social de los habitantes, por su voluntad y fe cristiana toman la decisión de ponerle un nombre al lugar, y fue entonces que se nombró San Jacinto, por el santo al que le hacían celebraciones y Búa, por el río que recorre la zona.

En el año de 1950 la ciudad estaba completamente deshabitada, solo existían tres colonos que se ubicaban a 5 km de distancia.

En 1956 empiezan a llegar los primeros habitantes a la región atraídos por la vegetación del lugar.

La diversidad que existía en el sitio se debería una crisis que ocurría en el país por esos años.

En 1960 los colonos poblaron estableciéndose oficialmente y la economía del lugar empezaría a crecer rápidamente.