La segunda montaña más alta es el Monte Bayoso con 405 metros sobre el nivel del mar.
San Enrique es generalmente plano, mientras que algunas partes son montañosas y ondulantes con la elevación más alta siendo 560 metros sobre el nivel del mar.
También hay varios arroyos que atraviesan el municipio: Dumiles, Hinayan y Agutayan.
Talinab Spring ubicado en Barangay Lip-ac, en la parte inferior del Monte Cabas-an, suministra agua a Poblacion.
Hay ocho tipos de suelo presentes en el municipio y beneficiosos para la agricultura: El sistema de drenaje existente en el municipio se basa en las elevaciones naturales y el diseño del terreno.