Del Paleolítico hay varios yacimientos arqueológicos en Sant Roc (Balma de la chimenea, cementerio de moros, la olla grande...)[3].
[5] En cuanto a época ibérica y romana Hay varios hallazgos de monedas hechas por Josep Vilalta de Amer, junto con Francisco (Xicu) Caparrós y la familia Climent de Anglès a finales del siglo XX.
San Clemente de Amer perdió población hasta ser casi despoblado.
La tendencia se invirtió con la llegada de gente de fuera que decidió instalarse en ella y actualmente se encuentra habitado[6].
La iglesia parroquial, probablemente del siglo XVII, fue lugar real y está dedicada al papa Clemente I.